"Vi uppmanar de egyptiska myndigheterna att respektera folkets universella rättigheter. Vi uppmanar de som protesterar att göra det fredligt och fördöma attackerna som vi har sett av demonstranter, inklusive mot kyrkor”, sa han och tillade att rättigheterna för kvinnor och landets religiösa minoriteter bör respekteras.
"Åtaganden måste hållas för att fullfölja transparenta reformer av konstitutionen och demokratiska val av ett parlament och en president. Och att följa den vägen kommer att hjälpa Egypten att möta de demokratiska ambitionerna hos sitt folk samtidigt som de attraherar investeringar, turism och internationellt stöd som kan hjälpa det att ge möjligheter till sina medborgare, sade han.
USA vill samarbeta med det egyptiska folket i deras strävan efter en bättre framtid, men det är upp till egyptierna själva att avgöra vad den framtiden kommer att bli, sa han.
"Vi uppskattar komplexiteten i situationen. Medan Mohamed Morsy valdes till president i ett demokratiskt val, var hans regering inte inkluderande och respekterade inte alla egyptiers åsikter”, sa han.
Men samtidigt "tar vi inte parti för något särskilt parti eller politisk figur", sa Obama.
"Jag vet att det är frestande inom Egypten att skylla på USA eller väst eller någon annan utomstående aktör för det som har gått fel. Vi har fått skulden av anhängare till Morsy; vi har fått skulden av den andra sidan som om vi är anhängare av Morsy. Den typen av tillvägagångssätt kommer inte att hjälpa egyptierna att uppnå den framtid som de förtjänar”, sa han.
USA vill se egyptierna arbeta tillsammans för att lyckas som ett fredligt, demokratiskt och välmående land, och presidenten erkände att det kommer att bli svårt ibland.
"Det kommer att bli tjuvstarter. Det kommer att bli svåra dagar. Amerikas demokratiska resa tog oss igenom några mäktiga kamper för att fullända vår union. Från Asien till Amerika vet vi att demokratiska övergångar inte mäts i månader eller till och med år, utan ibland i generationer, säger Obama.