Reglerna kommer att gälla från och med den 28 september för alla i England som testar positivt för viruset eller som meddelas av folkhälsopersonal att de har varit i kontakt med någon smittsam.
"Människor som väljer att ignorera reglerna kommer att få betydande böter", sa Johnson i ett uttalande.
Böterna börjar på 1,000 10,000 pund för ett första brott och stiger till XNUMX XNUMX pund för återfallsförbrytare eller fall där arbetsgivare hotar att säga upp personal som isolerar sig istället för att gå till jobbet.
Vissa låginkomsttagare som lider av en inkomstbortfall kommer att få en stödbetalning på £500, utöver andra förmåner som sjuklön som de kan ha rätt till.
Nuvarande brittiska regeringsvägledning säger åt människor att stanna hemma i minst 10 dagar efter att de börjar lida av covid-19-symptom, och att andra människor i deras hushåll inte ska lämna huset på 14 dagar.
Den som testar positivt uppmanas också att lämna uppgifter om personer utanför hushållet som de har varit i nära kontakt med, som då också kan bli tillsagda att isolera sig.
Hittills har det varit lite tillämpning av reglerna för självisolering, förutom i vissa fall där människor har återvänt från utlandet.
Men Storbritannien står nu inför en snabb ökning av fall, och regeringen sa att polisen skulle vara inblandad i att kontrollera efterlevnaden i områden med de högsta infektionstalen.
Johnson har också mött uppmaningar att återinföra mer omfattande låsningsregler för allmänheten.
Emellertid den Sunday Times rapporterade att han var redo att avvisa samtal från vetenskapliga rådgivare om en omedelbar två veckors rikstäckande låsning för att bromsa spridningen av sjukdomen, och istället ompröva det när skolorna tar en paus i slutet av oktober.